Din colaborarea dintre știință și industrie a apărut o metodă inovatoare de combatere a bolilor culturilor folosind bacterii locale benefice din sol.
O echipă de oameni de știință de la Centrul John Innes (Marea Britanie) a izolat și a testat sute de tulpini de bacterii Pseudomonas din sol colectat de la fermele și apoi a secvențiat genomul a 69 dintre ele.
Comparând genomul acelor tulpini care inhibă activitatea patogenului cu cei care nu o fac, echipa a reușit să identifice un mecanism cheie pentru protejarea culturii de cartofi de bacteriile dăunătoare.
Apoi, folosind o combinație de chimie și genetică și o serie de experimente, oamenii de știință au arătat că producția de molecule mici numite lipopeptide ciclice este importantă în controlul crustei cartofului (o boală bacteriană care provoacă daune semnificative culturii de cartofi). Aceste molecule mici au un efect antibacterian asupra bacteriilor patogene care cauzează crusta și ajută bacteriile benefice Pseudomonas să migreze și să colonizeze rădăcinile plantelor.
Experimentele au arătat, de asemenea, că irigarea provoacă schimbări semnificative în populația diversă genetic de Pseudomonas din sol.
Studiul, publicat în eLife, oferă o metodă prin care oamenii de știință pot studia microbiomul practic oricărei zone a unui câmp și pot lua în considerare diferite condiții de sol, agrochimice și de mediu.
Folosind progresele în secvențierea genetică de mare viteză, oamenii de știință pot testa microbiomul solului pentru bacterii benefice și pot determina ce molecule sunt produse pentru a suprima agenții patogeni. Următorul pas este propagarea și returnarea microorganismelor benefice în același câmp.
Aplicațiile potențiale pentru amelioratori de microbiom includ aplicarea cocktail-urilor bacteriene pe suprafața tuberculilor sub formă de spray sau direct în sol folosind irigarea prin picurare.